MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021881	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021881	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021881	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021881	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021881	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021881	TA	3	6	2800	2805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021881	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021881	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021881	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021881	ATCT	2	8	5613	5620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021881	CTAT	2	8	5638	5645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021881	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021881	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021881	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021881	AAAT	2	8	5824	5831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021881	A	6	6	5922	5927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021881	ATTA	2	8	5944	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021881	A	6	6	5957	5962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021881	CAAT	2	8	5980	5987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021881	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021881	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021881	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021881	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021881	T	6	6	7030	7035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021881	GAG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021881	GC	3	6	7744	7749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021881	GTT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021881	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021881	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021881	ATA	2	6	9095	9100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021881	ATA	2	6	9105	9110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021881	ATA	2	6	9119	9124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021881	TAAGT	2	10	9148	9157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021881	TGT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021881	GT	3	6	10500	10505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021881	A	6	6	10628	10633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021881	GTAT	2	8	10634	10641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021881	AGC	2	6	10650	10655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021881	AT	3	6	10694	10699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021881	ATAA	2	8	10702	10709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021881	AAT	2	6	10716	10721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021881	A	6	6	10760	10765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021881	ATA	2	6	10790	10795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021881	A	7	7	10903	10909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021881	AGA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021881	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021881	GAT	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021881	GT	3	6	11045	11050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021881	CTG	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021881	GCA	2	6	11087	11092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021881	TAT	2	6	11095	11100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021881	AAG	2	6	11156	11161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021881	AGC	2	6	11214	11219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021881	CTAT	2	8	11343	11350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021881	TGC	2	6	11360	11365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021881	AT	3	6	11370	11375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021881	TAA	3	9	11461	11469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021881	A	7	7	12152	12158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021881	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021881	TAA	2	6	12238	12243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021881	TAA	2	6	12264	12269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021881	A	6	6	12268	12273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021881	ACT	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021881	TAA	2	6	12330	12335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021881	CAT	2	6	12365	12370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021881	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021881	CTT	2	6	15408	15413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021881	T	6	6	15412	15417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021881	GAA	2	6	15427	15432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021881	ATC	2	6	17484	17489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021881	TA	4	8	20557	20564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021881	AAT	2	6	20649	20654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021881	TGTT	2	8	20711	20718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021881	ACA	2	6	20735	20740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021881	T	7	7	20772	20778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021881	CA	3	6	20851	20856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021881	AAAAT	2	10	20879	20888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021881	CAG	2	6	21834	21839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021881	T	6	6	22335	22340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021881	ATT	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021881	T	6	6	23658	23663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021881	T	6	6	23669	23674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021881	TAA	2	6	24493	24498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021881	AAG	2	6	25919	25924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021881	ACAAT	2	10	25929	25938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021881	TAA	2	6	25941	25946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021881	ATA	2	6	25974	25979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021881	TAA	2	6	25990	25995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021881	AGG	2	6	26042	26047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021881	T	6	6	26075	26080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021881	TTTA	2	8	26120	26127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021881	ATT	2	6	26192	26197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021881	GA	3	6	26226	26231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021881	GCT	2	6	26700	26705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021881	AGC	2	6	26805	26810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021881	AAC	2	6	26835	26840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021881	TAG	2	6	26862	26867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021881	TAC	2	6	26894	26899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021881	TAA	3	9	26930	26938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021881	TTAT	2	8	26957	26964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021881	CTAG	2	8	26967	26974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021881	AT	3	6	27035	27040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021881	TC	3	6	27146	27151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021881	GTAC	2	8	27237	27244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021881	GTA	2	6	27271	27276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021881	AGC	3	9	27910	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021881	AAC	2	6	27940	27945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021881	TAG	2	6	27967	27972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021881	CTT	2	6	27987	27992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021881	CT	3	6	27993	27998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021881	AAT	2	6	27999	28004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021881	AAT	2	6	28045	28050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021881	ATA	2	6	28068	28073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021881	AAT	2	6	28085	28090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021881	GTA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021881	AGGAG	2	10	28192	28201	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021881	TCT	2	6	28319	28324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021881	ATT	2	6	28349	28354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021881	CTTA	2	8	28532	28539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021881	AAGC	2	8	28622	28629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021881	A	6	6	28750	28755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021881	ACT	2	6	28761	28766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021881	TCA	2	6	28784	28789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021881	ACGC	2	8	30783	30790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021881	TGT	2	6	30833	30838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021881	TAA	2	6	31185	31190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021881	ATTA	2	8	31197	31204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021881	AAC	2	6	31259	31264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021881	ATC	2	6	31279	31284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021881	ATT	2	6	31316	31321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021881	CGGA	2	8	31337	31344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021881	TCCG	2	8	31417	31424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021881	GTA	2	6	31457	31462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021881	GAA	2	6	31487	31492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021881	TAT	2	6	31512	31517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021881	AT	3	6	31526	31531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021881	ACG	2	6	31534	31539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021881	CGT	2	6	31550	31555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021881	TGC	2	6	31594	31599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021881	CAG	2	6	31626	31631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021881	ATT	2	6	31657	31662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021881	TA	3	6	33356	33361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021881	ATA	2	6	36523	36528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021881	AT	3	6	36620	36625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021881	AAT	2	6	36648	36653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021881	TG	3	6	37723	37728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021881	GAG	2	6	37964	37969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021881	TG	3	6	38054	38059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021881	GGTA	2	8	38774	38781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_021881	GA	3	6	78245	78250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_021881	ACA	2	6	105771	105776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_021881	ATT	2	6	105848	105853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021881	GTAGG	2	10	121144	121153	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

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